1_Summary;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Sequence ID;V-DOMAIN Functionality;V-GENE and allele;V-REGION identity %;V-REGION identity nt;V-REGION identity % (with ins/del events);V-REGION identity nt (with ins/del events);J-GENE and allele;J-REGION identity %;J-REGION identity nt;D-GENE and allele;D-REGION reading frame;CDR1-IMGT length;CDR2-IMGT length;CDR3-IMGT length;CDR-IMGT lengths;FR-IMGT lengths;AA JUNCTION;JUNCTION frame;Sequence;V-REGION insertions;V-REGION deletions;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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2_IMGT-gapped-nt-sequences;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
V-D-J-REGION;V-J-REGION;V-REGION;FR1-IMGT;CDR1-IMGT;FR2-IMGT;CDR2-IMGT;FR3-IMGT;CDR3-IMGT;JUNCTION;J-REGION;FR4-IMGT;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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3_Nt-sequences;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
V-D-J-REGION;V-J-REGION;V-REGION;FR1-IMGT;CDR1-IMGT;FR2-IMGT;CDR2-IMGT;FR3-IMGT;CDR3-IMGT;JUNCTION;3'V-REGION;(N-D)-J-REGION;(N-D)-REGION;P3'V;N-REGION;N1-REGION;P5'D;D-REGION;P3'D;P5'D1;D1-REGION;P3'D1;N2-REGION;P5'D2;D2-REGION;P3'D2;N3-REGION;P5'D3;D3-REGION;P3'D3;N4-REGION;P5'J;5'J-REGION;D-J-REGION;J-REGION;FR4-IMGT;V-D-J-REGION start;V-D-J-REGION end;V-J-REGION start;V-J-REGION end;V-REGION start;V-REGION end;FR1-IMGT start;FR1-IMGT end;CDR1-IMGT start;CDR1-IMGT end;FR2-IMGT start;FR2-IMGT end;CDR2-IMGT start;CDR2-IMGT end;FR3-IMGT start;FR3-IMGT end;CDR3-IMGT start;CDR3-IMGT end;JUNCTION start;JUNCTION end;3'V-REGION start;3'V-REGION end;(N-D)-J-REGION start;(N-D)-J-REGION end;(N-D)-REGION start;(N-D)-REGION end;P3'V start;P3'V end;N-REGION start;N-REGION end;N1-REGION start;N1-REGION end;P5'D start;P5'D end;D-REGION start;D-REGION end;P3'D start;P3'D end;P5'D1 start;P5'D1 end;D1-REGION start;D1-REGION end;P3'D1 start;P3'D1 end;N2-REGION start;N2-REGION end;P5'D2 start;P5'D2 end;D2-REGION start;D2-REGION end;P3'D2 start;P3'D2 end;N3-REGION start;N3-REGION end;P5'D3 start;P5'D3 end;D3-REGION start;D3-REGION end;P3'D3 start;P3'D3 end;N4-REGION start;N4-REGION end;P5'J start;P5'J end;5'J-REGION start;5'J-REGION end;D-J-REGION start;D-J-REGION end;J-REGION start;J-REGION end;FR4-IMGT start;FR4-IMGT end;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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4_IMGT-gapped-AA-sequences;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
V-D-J-REGION;V-J-REGION;V-REGION;FR1-IMGT;CDR1-IMGT;FR2-IMGT;CDR2-IMGT;FR3-IMGT;CDR3-IMGT;JUNCTION;J-REGION;FR4-IMGT;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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5_AA-sequences;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
V-D-J-REGION;V-J-REGION;V-REGION;FR1-IMGT;CDR1-IMGT;FR2-IMGT;CDR2-IMGT;FR3-IMGT;CDR3-IMGT;JUNCTION;J-REGION;FR4-IMGT;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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6_Junction;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
JUNCTION (with frameshift);JUNCTION-nt nb;3'V-REGION-nt nb;P3'V-nt nb;N-REGION-nt nb;N1-REGION-nt nb;P5'D-nt nb;D-REGION-nt nb;P3'D-nt nb;P5'D1-nt nb;D1-REGION-nt nb;P3'D1-nt nb;N2-REGION-nt nb;P5'D2-nt nb;D2-REGION-nt nb;P3'D2-nt nb;N3-REGION-nt nb;P5'D3-nt nb;D3-REGION-nt nb;P3'D2-nt nb;N4-REGION-nt nb;P5'J-nt nb;5'J-REGION-nt nb;3'V-REGION trimmed-nt nb;5'D-REGION trimmed-nt nb;3'D-REGION trimmed-nt nb;5'D1-REGION trimmed-nt nb;3'D1-REGION trimmed-nt nb;5'D2-REGION trimmed-nt nb;3'D2-REGION trimmed-nt nb;5'D3-REGION trimmed-nt nb;3'D3-REGION trimmed-nt nb;5'J-REGION trimmed-nt nb;3'V-REGION mut-nt nb;D-REGION mut-nt nb;D1-REGION mut-nt nb;D2-REGION mut-nt nb;D3-REGION mut-nt nb;5'J-REGION mut-nt nb;D-REGION reading frame;Ngc;Molecular mass;pI;CDR3-IMGT-nt nb;CDR3-IMGT (with frameshift);CDR3-IMGT (AA) (with frameshift);JUNCTION (AA) (with frameshift);;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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7_V-REGION-mutation-and-AA-change-table;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
V-REGION;FR1-IMGT;CDR1-IMGT;FR2-IMGT;CDR2-IMGT;FR3-IMGT;CDR3-IMGT;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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8_V-REGION-nt-mutation-statistics;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
V-REGION Nb of positions including IMGT gaps (nt);V-REGION Nb of nucleotides;V-REGION Nb of identical nucleotides;V-REGION Nb of mutations;V-REGION Nb of silent mutations;V-REGION Nb of nonsilent mutations;V-REGION a>g;V-REGION g>a;V-REGION c>t;V-REGION t>c;V-REGION a>c;V-REGION c>a;V-REGION a>t;V-REGION t>a;V-REGION g>c;V-REGION c>g;V-REGION g>t;V-REGION t>g;FR1-IMGT Nb of positions including IMGT gaps (nt);FR1-IMGT Nb of nucleotides;FR1-IMGT Nb of identical nucleotides;FR1-IMGT Nb of mutations;FR1-IMGT Nb of silent mutations;FR1-IMGT Nb of nonsilent mutations;FR1-IMGT a>g;FR1-IMGT g>a;FR1-IMGT c>t;FR1-IMGT t>c;FR1-IMGT a>c;FR1-IMGT c>a;FR1-IMGT a>t;FR1-IMGT t>a;FR1-IMGT g>c;FR1-IMGT c>g;FR1-IMGT g>t;FR1-IMGT t>g;CDR1-IMGT Nb of positions including IMGT gaps (nt);CDR1-IMGT Nb of nucleotides;CDR1-IMGT Nb of identical nucleotides;CDR1-IMGT Nb of mutations;CDR1-IMGT Nb of silent mutations;CDR1-IMGT Nb of nonsilent mutations;CDR1-IMGT a>g;CDR1-IMGT g>a;CDR1-IMGT c>t;CDR1-IMGT t>c;CDR1-IMGT a>c;CDR1-IMGT c>a;CDR1-IMGT a>t;CDR1-IMGT t>a;CDR1-IMGT g>c;CDR1-IMGT c>g;CDR1-IMGT g>t;CDR1-IMGT t>g;FR2-IMGT Nb of positions including IMGT gaps (nt);FR2-IMGT Nb of nucleotides;FR2-IMGT Nb of identical nucleotides;FR2-IMGT Nb of mutations;FR2-IMGT Nb of silent mutations;FR2-IMGT Nb of nonsilent mutations;FR2-IMGT a>g;FR2-IMGT g>a;FR2-IMGT c>t;FR2-IMGT t>c;FR2-IMGT a>c;FR2-IMGT c>a;FR2-IMGT a>t;FR2-IMGT t>a;FR2-IMGT g>c;FR2-IMGT c>g;FR2-IMGT g>t;FR2-IMGT t>g;CDR2-IMGT Nb of positions including IMGT gaps (nt);CDR2-IMGT Nb of nucleotides;CDR2-IMGT Nb of identical nucleotides;CDR2-IMGT Nb of mutations;CDR2-IMGT Nb of silent mutations;CDR2-IMGT Nb of nonsilent mutations;CDR2-IMGT a>g;CDR2-IMGT g>a;CDR2-IMGT c>t;CDR2-IMGT t>c;CDR2-IMGT a>c;CDR2-IMGT c>a;CDR2-IMGT a>t;CDR2-IMGT t>a;CDR2-IMGT g>c;CDR2-IMGT c>g;CDR2-IMGT g>t;CDR2-IMGT t>g;FR3-IMGT Nb of positions including IMGT gaps (nt);FR3-IMGT Nb of nucleotides;FR3-IMGT Nb of identical nucleotides;FR3-IMGT Nb of mutations;FR3-IMGT Nb of silent mutations;FR3-IMGT Nb of nonsilent mutations;FR3-IMGT a>g;FR3-IMGT g>a;FR3-IMGT c>t;FR3-IMGT t>c;FR3-IMGT a>c;FR3-IMGT c>a;FR3-IMGT a>t;FR3-IMGT t>a;FR3-IMGT g>c;FR3-IMGT c>g;FR3-IMGT g>t;FR3-IMGT t>g;CDR3-IMGT Nb of positions including IMGT gaps (nt);CDR3-IMGT Nb of nucleotides;CDR3-IMGT Nb of identical nucleotides;CDR3-IMGT Nb of mutations;CDR3-IMGT Nb of silent mutations;CDR3-IMGT Nb of nonsilent mutations;CDR3-IMGT a>g;CDR3-IMGT g>a;CDR3-IMGT c>t;CDR3-IMGT t>c;CDR3-IMGT a>c;CDR3-IMGT c>a;CDR3-IMGT a>t;CDR3-IMGT t>a;CDR3-IMGT g>c;CDR3-IMGT c>g;CDR3-IMGT g>t;CDR3-IMGT t>g
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9_V-REGION-AA-mutation-statistics;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
V-REGION Nb of positions including IMGT gaps (AA);V-REGION Nb of AA;V-REGION Nb of identical AA;V-REGION Nb of AA changes;V-REGION +++;V-REGION ++-;V-REGION +-+;V-REGION +--;V-REGION -+-;V-REGION --+;V-REGION ---;V-REGION Very similar;V-REGION Similar;V-REGION Dissimilar;V-REGION Very dissimilar;FR1-IMGT Nb of positions including IMGT gaps (AA);FR1-IMGT Nb of AA;FR1-IMGT Nb of identical AA;FR1-IMGT Nb of AA changes;FR1-IMGT +++;FR1-IMGT ++-;FR1-IMGT +-+;FR1-IMGT +--;FR1-IMGT -+-;FR1-IMGT --+;FR1-IMGT ---;FR1-IMGT Very similar;FR1-IMGT Similar;FR1-IMGT Dissimilar;FR1-IMGT Very dissimilar;CDR1-IMGT Nb of positions including IMGT gaps (AA);CDR1-IMGT Nb of AA;CDR1-IMGT Nb of identical AA;CDR1-IMGT Nb of AA changes;CDR1-IMGT +++;CDR1-IMGT ++-;CDR1-IMGT +-+;CDR1-IMGT +--;CDR1-IMGT -+-;CDR1-IMGT --+;CDR1-IMGT ---;CDR1-IMGT Very similar;CDR1-IMGT Similar;CDR1-IMGT Dissimilar;CDR1-IMGT Very dissimilar;FR2-IMGT Nb of positions including IMGT gaps (AA);FR2-IMGT Nb of AA;FR2-IMGT Nb of identical AA;FR2-IMGT Nb of AA changes;FR2-IMGT +++;FR2-IMGT ++-;FR2-IMGT +-+;FR2-IMGT +--;FR2-IMGT -+-;FR2-IMGT --+;FR2-IMGT ---;FR2-IMGT Very similar;FR2-IMGT Similar;FR2-IMGT Dissimilar;FR2-IMGT Very dissimilar;CDR2-IMGT Nb of positions including IMGT gaps (AA);CDR2-IMGT Nb of AA;CDR2-IMGT Nb of identical AA;CDR2-IMGT Nb of AA changes;CDR2-IMGT +++;CDR2-IMGT ++-;CDR2-IMGT +-+;CDR2-IMGT +--;CDR2-IMGT -+-;CDR2-IMGT --+;CDR2-IMGT ---;CDR2-IMGT Very similar;CDR2-IMGT Similar;CDR2-IMGT Dissimilar;CDR2-IMGT Very dissimilar;FR3-IMGT Nb of positions including IMGT gaps (AA);FR3-IMGT Nb of AA;FR3-IMGT Nb of identical AA;FR3-IMGT Nb of AA changes;FR3-IMGT +++;FR3-IMGT ++-;FR3-IMGT +-+;FR3-IMGT +--;FR3-IMGT -+-;FR3-IMGT --+;FR3-IMGT ---;FR3-IMGT Very similar;FR3-IMGT Similar;FR3-IMGT Dissimilar;FR3-IMGT Very dissimilar;CDR3-IMGT Nb of positions including IMGT gaps (AA);CDR3-IMGT Nb of AA;CDR3-IMGT Nb of identical AA;CDR3-IMGT Nb of AA changes;CDR3-IMGT +++;CDR3-IMGT ++-;CDR3-IMGT +-+;CDR3-IMGT +--;CDR3-IMGT -+-;CDR3-IMGT --+;CDR3-IMGT ---;CDR3-IMGT Very similar;CDR3-IMGT Similar;CDR3-IMGT Dissimilar;CDR3-IMGT Very dissimilar;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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10_V-REGION-mutation-hotspots;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
(a/t)a;t(a/t);(a/g)g(c/t)(a/t);(a/t)(a/g)c(c/t);;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
