*   u s i n g   l o g   d i r e c t o r y   ' E : / G E x P i p e / G E x P i p e . R c h e c k ' 
 
 *   u s i n g   R   v e r s i o n   4 . 6 . 0   ( 2 0 2 6 - 0 4 - 2 4   u c r t ) 
 
 *   u s i n g   p l a t f o r m :   x 8 6 _ 6 4 - w 6 4 - m i n g w 3 2 
 
 *   R   w a s   c o m p i l e d   b y 
 
         g c c . e x e   ( G C C )   1 4 . 3 . 0 
 
         G N U   F o r t r a n   ( G C C )   1 4 . 3 . 0 
 
 *   r u n n i n g   u n d e r :   W i n d o w s   1 1   x 6 4   ( b u i l d   2 6 2 0 0 ) 
 
 *   u s i n g   s e s s i o n   c h a r s e t :   U T F - 8 
 
 *   c u r r e n t   t i m e :   2 0 2 6 - 0 7 - 0 7   1 0 : 1 4 : 4 7   U T C 
 
 *   u s i n g   o p t i o n   ' - - n o - m a n u a l ' 
 
 *   c h e c k i n g   f o r   f i l e   ' G E x P i p e / D E S C R I P T I O N '   . . .   O K 
 
 *   t h i s   i s   p a c k a g e   ' G E x P i p e '   v e r s i o n   ' 0 . 9 9 . 1 8 ' 
 
 *   p a c k a g e   e n c o d i n g :   U T F - 8 
 
 *   c h e c k i n g   p a c k a g e   n a m e s p a c e   i n f o r m a t i o n   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   p a c k a g e   d e p e n d e n c i e s   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   i f   t h i s   i s   a   s o u r c e   p a c k a g e   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   i f   t h e r e   i s   a   n a m e s p a c e   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   f o r   . d l l   a n d   . e x e   f i l e s   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   f o r   h i d d e n   f i l e s   a n d   d i r e c t o r i e s   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   f o r   p o r t a b l e   f i l e   n a m e s   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   w h e t h e r   p a c k a g e   ' G E x P i p e '   c a n   b e   i n s t a l l e d   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   p a c k a g e   d i r e c t o r y   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   ' b u i l d '   d i r e c t o r y   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   D E S C R I P T I O N   m e t a - i n f o r m a t i o n   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   t o p - l e v e l   f i l e s   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   f o r   l e f t - o v e r   f i l e s   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   i n d e x   i n f o r m a t i o n   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   p a c k a g e   s u b d i r e c t o r i e s   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   c o d e   f i l e s   f o r   n o n - A S C I I   c h a r a c t e r s   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   R   f i l e s   f o r   s y n t a x   e r r o r s   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   w h e t h e r   t h e   p a c k a g e   c a n   b e   l o a d e d   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   w h e t h e r   t h e   p a c k a g e   c a n   b e   l o a d e d   w i t h   s t a t e d   d e p e n d e n c i e s   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   w h e t h e r   t h e   p a c k a g e   c a n   b e   u n l o a d e d   c l e a n l y   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   w h e t h e r   t h e   n a m e s p a c e   c a n   b e   l o a d e d   w i t h   s t a t e d   d e p e n d e n c i e s   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   w h e t h e r   t h e   n a m e s p a c e   c a n   b e   u n l o a d e d   c l e a n l y   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   l o a d i n g   w i t h o u t   b e i n g   o n   t h e   l i b r a r y   s e a r c h   p a t h   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   d e p e n d e n c i e s   i n   R   c o d e   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   S 3   g e n e r i c / m e t h o d   c o n s i s t e n c y   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   r e p l a c e m e n t   f u n c t i o n s   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   f o r e i g n   f u n c t i o n   c a l l s   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   R   c o d e   f o r   p o s s i b l e   p r o b l e m s   . . .   N O T E 
 
 g e x p _ p l o t _ d e v i c e _ o p e n :   n o   v i s i b l e   g l o b a l   f u n c t i o n   d e f i n i t i o n   f o r   ' p n g ' 
 
 g e x p _ p l o t _ d e v i c e _ o p e n :   n o   v i s i b l e   g l o b a l   f u n c t i o n   d e f i n i t i o n   f o r   ' j p e g ' 
 
 g e x p _ p l o t _ d e v i c e _ o p e n :   n o   v i s i b l e   g l o b a l   f u n c t i o n   d e f i n i t i o n   f o r   ' p d f ' 
 
 U n d e f i n e d   g l o b a l   f u n c t i o n s   o r   v a r i a b l e s : 
 
     j p e g   p d f   p n g 
 
 C o n s i d e r   a d d i n g 
 
     i m p o r t F r o m ( " g r D e v i c e s " ,   " j p e g " ,   " p d f " ,   " p n g " ) 
 
 t o   y o u r   N A M E S P A C E   f i l e . 
 
 *   c h e c k i n g   R d   f i l e s   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   R d   m e t a d a t a   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   R d   c r o s s - r e f e r e n c e s   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   f o r   m i s s i n g   d o c u m e n t a t i o n   e n t r i e s   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   f o r   c o d e / d o c u m e n t a t i o n   m i s m a t c h e s   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   R d   \ u s a g e   s e c t i o n s   . . .   W A R N I N G 
 
 U n d o c u m e n t e d   a r g u m e n t s   i n   R d   f i l e   ' g e x p _ d r a w _ m l _ m e t h o d s _ v e n n . R d ' 
 
     ' s e t s '   ' t i t l e '   ' t e x t _ s c a l e '   ' s h o w _ f o o t e r ' 
 
 
 
 U n d o c u m e n t e d   a r g u m e n t s   i n   R d   f i l e   ' g e x p _ m l _ c o m m o n _ g e n e _ c o u n t . R d ' 
 
     ' s e t s ' 
 
 
 
 U n d o c u m e n t e d   a r g u m e n t s   i n   R d   f i l e   ' g e x p _ m l _ p r e p a r e _ u p s e t _ d f . R d ' 
 
     ' s e t s ' 
 
 
 
 U n d o c u m e n t e d   a r g u m e n t s   i n   R d   f i l e   ' g e x p _ m l _ v e n n _ p a l e t t e . R d ' 
 
     ' n ' 
 
 
 
 U n d o c u m e n t e d   a r g u m e n t s   i n   R d   f i l e   ' g e x p _ m l _ v e n n _ s e t s _ f o r _ s e l e c t e d . R d ' 
 
     ' g e n e _ l i s t s '   ' m e t h o d s _ s e l ' 
 
 
 
 F u n c t i o n s   w i t h   \ u s a g e   e n t r i e s   n e e d   t o   h a v e   t h e   a p p r o p r i a t e   \ a l i a s 
 
 e n t r i e s ,   a n d   a l l   t h e i r   a r g u m e n t s   d o c u m e n t e d . 
 
 T h e   \ u s a g e   e n t r i e s   m u s t   c o r r e s p o n d   t o   s y n t a c t i c a l l y   v a l i d   R   c o d e . 
 
 S e e   c h a p t e r   ' W r i t i n g   R   d o c u m e n t a t i o n   f i l e s '   i n   t h e   ' W r i t i n g   R 
 
 E x t e n s i o n s '   m a n u a l . 
 
 *   c h e c k i n g   R d   c o n t e n t s   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   f o r   u n s t a t e d   d e p e n d e n c i e s   i n   e x a m p l e s   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   i n s t a l l e d   f i l e s   f r o m   ' i n s t / d o c '   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   f i l e s   i n   ' v i g n e t t e s '   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   e x a m p l e s   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   f o r   u n s t a t e d   d e p e n d e n c i e s   i n   ' t e s t s '   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   t e s t s   . . . 
 
     R u n n i n g   ' t e s t t h a t . R ' 
 
   O K 
 
 *   c h e c k i n g   f o r   u n s t a t e d   d e p e n d e n c i e s   i n   v i g n e t t e s   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   p a c k a g e   v i g n e t t e s   . . .   O K 
 
 *   c h e c k i n g   r e - b u i l d i n g   o f   v i g n e t t e   o u t p u t s   . . .   O K 
 
 *   D O N E 
 
 S t a t u s :   1   W A R N I N G ,   1   N O T E 
 
 R . e x e   :   
 
 A t   C : \ U s e r s \ A d m i n i s t r a t o r \ A p p D a t a \ L o c a l \ T e m p \ p s - s c r i p t - f d 5 b e 9 a f - f 9 9 f - 4 c 3 7 - b 4 b 7 - 1 c 5 a e 0 0 7 5 1 5 7 . p s 1 : 1 2 1   c h a r : 1 
 
 +   &   $ R   C M D   c h e c k   $ t a r   - - n o - m a n u a l   2 > & 1   |   T e e - O b j e c t   - F i l e P a t h   " e : \ G E x P i   . . . 
 
 +   ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ 
 
         +   C a t e g o r y I n f o                     :   N o t S p e c i f i e d :   ( : S t r i n g )   [ ] ,   R e m o t e E x c e p t i o n 
 
         +   F u l l y Q u a l i f i e d E r r o r I d   :   N a t i v e C o m m a n d E r r o r 
 
   
 
 S e e 
 
     ' E : / G E x P i p e / G E x P i p e . R c h e c k / 0 0 c h e c k . l o g ' 
 
 f o r   d e t a i l s . 
 
 
 
 